Το Τμήμα Πολιτικής Επιστήμης του Πανεπιστημίου Κρήτης είναι ένα σύγχρονο τμήμα που σκοπό έχει την προαγωγή της έρευνας και της διδασκαλίας στην πολιτική επιστήμη για την εμβάθυνση και κριτική διαχείριση των πολιτικών ζητημάτων αλλά και την μετάδοση των απαραίτητων δεξιοτήτων, τεχνικών και μεθόδων. Σε αντίθεση με τα περισσότερα αντίστοιχα τμήματα στα ελληνικά πανεπιστήμια, που διαμορφώθηκαν στο πλαίσιο νομικών σχολών, το Τμήμα Πολιτικής Επιστήμης της Κρήτης συγκροτήθηκε εξαρχής και διαμορφώθηκε σε αμιγή βάση. Ακριβώς επειδή συγκροτήθηκε χωρίς θεσμικές δεσμεύσεις με άλλους κλάδους ή γνωστικά αντικείμενα, στους στόχους του περιλαμβάνεται η γνήσια διεπιστημονικότητα. Ο συνδυασμός αυτός του επιτρέπει να αναδείξει τόσο τα ιδιαίτερα χαρακτηριστικά του γνωστικού του αντικειμένου όπως αυτό έχει διαμορφωθεί διεθνώς, όσο και να συνεργαστεί με άλλους επιστημονικούς κλάδους στη βάση κοινών συνεργασιών για την προαγωγή της έρευνας και της διδασκαλίας. Το Τμήμα Πολιτικής Επιστήμης φιλοδοξεί να εκπαιδεύσει πολιτικούς επιστήμονες, ικανούς να αντεπεξέλθουν στις σύνθετες απαιτήσεις γνώσης και διαχείρισης των πολιτικών φαινομένων και της σύγχρονης δημόσιας πολιτικής σε εθνικό, υπερεθνικό και διεθνές επίπεδο. Προσφέρει μαθήματα και ερευνητική επίβλεψη στα βασικά πεδία (πολιτική φιλοσοφία και πολιτική θεωρία, συγκριτική και ευρωπαϊκή πολιτική, δημόσιες πολιτικές, πολιτική κοινωνιολογία, διεθνείς σχέσεις) καθώς επίσης και δεξιότητες απαραίτητες στους σημερινούς φοιτητές (Αγγλικά, χρήση ηλεκτρονικών υπολογιστών, χρήση SPSS, κ.α.). Στη βάση αυτή και σε συνδυασμό με τη συνεχή επιστημονική και ερευνητική ενασχόληση και παρουσία των μελών του, το Τμήμα φιλοδοξεί να συμβάλει ουσιαστικά στην ανάπτυξη της πολιτικής επιστήμης στην Ελλάδα καθώς και στην αναβάθμιση του ελληνικού πολιτικού συστήματος και της ελληνικής πολιτικής στην Ελλάδα και την ΕΕ.